Ola Jean!
No cliente que estou houve a necessidade de atualizar o ECC do SP 12 para o SP 14 para atender ao TDF, e neste caso, houve aplicação de SP's no ECC, e apenas 8 tabelas pequenas perderam a referencia " triggers" do SLT. Foi necessário iniciar uma nova carga dessas tabelas.
Já as nota do TDF não recomenda nenhuma ação de parar ou não o SLT, durante aplicações das notas disponibilizadas após o SP03.
Esta foi minha experiência e o feedback que tive do basis no projeto.
Respondendo sua pergunta, ira depender da complexidade da alteração. Sugiro consultar as notas:
SAP Note1655725- Check for DB trigger made less strict
SAP Note1749824- Treatment of SLT triggers during transport
Att.
Karen Rodrigues